血清淀粉酶除来源于胰腺外，还来源于唾液腺及许多其他组织，所以在淀粉酶活性升高时，同工酶的测定有助于的鉴别诊断。P-同工酶升高或降低时，说明可能有胰腺;S-同工酶的变化可能是源于唾液腺或其他组织。当血清淀粉酶活性升高而又诊断不清时，应进一步测定同工酶以助鉴别诊断。有许多方法可以测定同工酶，琼酯糖和醋纤膜电泳法都是比较常用的方法。

淀粉酶的测定结果受方法的影响较大，不同方法参考值亦有所不同，所用方法也较多，因此必须了解所用测定方法和其参考值，才能作出正确的诊断。