溶菌酶化学性质非常稳定，当pH值在一定范围内剧烈变化时，其结构几乎不变。溶菌酶不可逆变性的临界点是77℃，随溶剂的变化，不可逆变性临界点也发生变化，当溶菌酶所处溶液pH值小于1时，不可逆变性临界点降低到43℃

1． 溶菌酶是一种无毒、的蛋白质，又具有一定的溶菌作用，因此可用作天然的食品防腐剂。现已广泛应用于水产品、肉食品、蛋糕、清酒、料酒及饮料中的防腐；还可以添入乳粉中，使牛乳人乳化，以抑制中腐败微生物的生存，同时直接或间接地促进中双歧杆菌的增殖。

2． 溶菌酶作为一种存在于人体正常体液及组织中的因素，具有多种，它具有、、的，溶菌酶其适应症为、、血痰和等。

3． 溶菌酶具有破坏细菌细胞壁结构的功能，以此酶处理G+细菌得到 原生质体，因此，溶菌酶是基因工程、细胞工程中 细胞融合操作必不可少的工具酶。