在身体中赖氨酸还有其他。它和其他营养一起形成胶原蛋白。胶原蛋白在结缔组织，骨骼，肌肉，肌腱和关节软骨中扮演了重要角色。此外，赖氨酸也有助于身体吸收钙。

饮食中缺乏赖氨酸的情况是比较常见的。通常情况下吃素的人发生率较高，一些运动员如果没有采取适当的饮食也会出现赖氨酸缺乏的问题。蛋白质摄入量低（如豆类植物，豌豆，小扁豆等）也可能导致赖氨酸摄入量低。其最重要的生理功能是参与体蛋白的合成，因此与动物生长密切相关。赖氨酸在体内的功能有：参与体蛋白如骨骼肌、酶和多肽激素的合成；是生酮氨基酸之一，当缺乏可利用的碳水化合物时，可参与生成酮体和葡萄糖的代谢（在禁食情况下，是重要的能量来源之一）；维持体内酸碱平衡；作为合成肉毒碱的前体物，参与；另外，赖氨酸还可以提高机体抵的能力